I-motiv DNA ve fyziologickém prostředí

Téma již má řešitele.
Řešitel
Adam Sayduev Knap - Gymnázium Brno, Slovanské náměstí, příspěvková organizace
Instituce
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Další údaje o pracovišti
Biofyzika nukleových kyselin
Lektoři
Petra Školáková

DNA může vytvářet, kromě známé Watson-Crieckovy dvoušroubovice, také jiné typy sekundárních struktur. Mezi nejznámější a nejstudovanější patří čtyřřetězcové struktury. V oblastech DNA bohatých na cytozin se mohou vytvářet interkalované i-motivy. Tyto sekundární struktury jsou tvořeny hemiprotonizovanými C.C+ páry a stabilizovány jsou kyselým pH. Chceme ověřit výskyt těchto sekundárních struktur v buňce, a tedy jejich možnost vzniku ve fyziologických podmínkách. Stabilitu cytozinového i-motivu budeme studovat na syntetických oligonukleotidech pomocí cirkulárně dichroické a UV absorpční spektroskopie. Zajímat nás bude vliv kombinace iontů a také některých komponent nacházejících se v buněčném prostředí.