Funkce proteinů BOB při obnově růstu po krátkodobém tepelném stresu
Téma dosud nemá řešitele. Máš-li o něj zájem, zaregistruj se a přihlaš se k tématu.- Instituce
- Masarykova univerzita
- Fakulta/ústav
- CEITEC Masarykova univerzita
- Další údaje o pracovišti
- Plant Biotech for Stress Resilience
- Lektoři
- Kateřina Mácová
Přežití rostlin při zvýšených teplotách nezávisí pouze na okamžité aktivaci stresových mechanismů, ale také na schopnosti regenerace po odeznění stresu. Role proteinů BOB byla dosud studována především v kontextu embryonálního vývoje při teplotním stresu, jejich funkce během regenerace po stresovém působní však zůstává nejasná. Cílem projektu je zjistit, zda proteiny BOB přispívají k regeneraci růstu po krátkodobém tepelném šoku u modelové rostliny Arabidopsis thaliana.
Přírodní ekotyp Col-0 a CRISPR mutantní linie bob1 a bob2 budou pěstovány za standardních podmínek a následně vystaveny definovanému krátkodobému tepelnému stresu (např. 34 °C po dobu 3–6 hodin). Po návratu na kontrolní teplotu bude několik dní sledována dynamika regenerace. Hodnoceny budou parametry přežívání, expanze listové růžice, akumulace čerstvé biomasy a obsah chlorofylu jako ukazatel fotosyntetické výkonnosti.V případě časových možností může být projekt rozšířen o analýzu exprese vybraných markerů teplotní paměti (např. HSFA2 a malé heat shock proteiny) pomocí qRT-PCR, což by umožnilo posoudit, zda se případné rozdíly v regeneraci promítají i na úrovni transkripční odpovědi.
Student si během projektu osvojí práci s modelovou rostlinou Arabidopsis thaliana. Získá zkušenosti s prací ve sterilním prostředí, izolací DNA a základní genetickou analýzou, kvantitativním hodnocením růstových a fyziologických parametrů (přežívání, růst růžice, biomasa, obsah chlorofylu), vedením laboratorního deníku a statistickým vyhodnocením dat. Naučí se interpretovat výsledky v kontextu stresové fyziologie a vztahu mezi genotypem a fenotypem; v případě rozšíření projektu také základy analýzy genové exprese metodou qRT-PCR.