Segmentace shluků srdečních buněk
Téma již má řešitele.- Instituce
- Vysoké učení technické v Brně
- Fakulta/ústav
- Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
- Další údaje o pracovišti
- Ústav biomedicínského inženýrství
- Lektoři
- Jan Odstrčilík
Téma se zabývá analýzou digitálních video sekvencí shluků srdečních buněk diferencovaných z embryonálních buněk, tzv. Embryoid Bodies (EB). Řešitel bude mít za úkol seznámit se nejdříve s obecnými principy snímání biologických vzorků pomocí optického mikroskopu a konkrétně s vlastnostmi pořízených digitálních video sekvencí. Dále bude potřeba nastudovat odbornou literaturu z oblasti digitálních metod zpracování obrazu a zejména se zaměřit na metody segmentace a spektrální analýzy. Předmětem další práce bude praktická realizace vybrané metody segmentace kontury buněčného shluku za účelem odhadu parametrů kontrakce s cílem analyzovat vliv při aplikaci léčiva. Realizace bude probíhat ve vybraném programovém prostředí. Jako data pro analýzu budou sloužit video sekvence EB pořízené optickým mikroskopem s vysokorychlostní kamerou. Odborná literatura k zadanému tématu je téměř všechna k dispozici jen v anglickém jazyce. Po řešiteli projektu se tedy požaduje alespoň středně pokročilá znalost anglického jazyka, dále obecná schopnost orientace v odborné literatuře a rovněž základní programátorské znalosti.