DNA-vazebné proteiny v interakci se strukturou guaninového kvadruplexu
Téma již má řešitele.- Řešitel
- Adéla Adamová - Střední průmyslová škola chemická Brno, Vranovská, příspěvková organizace
- Instituce
- Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
- Další údaje o pracovišti
- Oddelení biofyziky nukleových kyselin
- Lektoři
- Denis Šubert
- Podpora
- JCMM podpořila toto SOČ téma částkou 7 500 Kč na materiál a částkou 10 000 Kč na honorář školitele.
Molekula DNA se nejčastěji vyskytuje ve formě dvouřetězcové pravotočivé šroubovice. Některé podmínky ale nahrávají tvorbě nestandardních sekundárních uspořádání, kam se řadí i čtyřřetězcové guaninové kvadruplexy (G4), které jsou předmětem zkoumání této práce. V lidském genomu je známo přes 700 000 oblastí vhodných k jejich tvorbě, jedná se převážně o regulační oblasti (promotory) nebo konce chromozomů (telomery). Sekundární struktury představují vhodné cíle pro vazbu velkého množství proteinů, které obsahují strukturní motivy důležité pro tuto interakci. V tomto projektu bude pomocí biochemických, biofyzikálních a molekulárně biologických metod zaměřena pozornost na vazebné motivy zinkového prstu a RGG boxu různých proteinů ve vztahu k DNA v různých konformacích.