Funkce promotorů biosenzoru kyseliny cis, cis-mukonové v mikrořase Chlamydomonas reinhardtii
Téma již má řešitele.- Řešitel
- Barbora Maloňová - Střední průmyslová škola Třebíč
- Instituce
- Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
- Další údaje o pracovišti
- Oddělení vývojové genetiky rostlin
- Lektoři
- Jan Mašek
Toxické látky na bázi fenolu se uvolňují do prostředí jako vedlejší důsledek ropného nebo farmaceutického průmyslu. Chemická likvidace znečištění fenolickými látkami je nákladná a málo efektivní. Jsou proto hledány jiné způsoby, jak tyto látky z přírody odstraňovat. Jednou z možností je fykoremediace, tedy využití řas.
Modelovým organismem, často využívaným v genetickém inženýrství, je mikrořasa Chlamydomonas reinhardtii. Ta je přirozeně schopna degradace řady fenolických látek, které jsou nejprve konvertovány na katechol a následně nejčastěji na kyselinu cis,cis-mukonovou (CCM).
Cílem této středoškolské odborné činnosti je zkoumat promotory fluorescenčního biosenzoru, který detekuje degradaci fenolických látek. Systém má za úkol při výskytu CCM v buňce indukovat tvorbu fluorescenčního signálu. Tato práce se bude zabývat efektivitou promotorů, které indukují tvorbu zeleného fluorescenčního proteinu GFP pomocí transkripčního regulátoru BenM. Tento protein za přítomnosti CCM aktivuje transkripci.
Práce bude zahrnovat sestavení a klonování promotorů cílového operonu pomocí polymerázové řetězové reakce (PCR) a Golden Gate klonování. Vzniklé konstrukty budou transformovány do kultury Chlamydomonas reinhardtii. Transkripce bude ověřena reverzně transkripční PCR a kultivačně detekcí signálu GFP pomocí fluorescenčního mikroskopu.