Stabilita i-motivu ve fyziologických podmínkách

Téma již má řešitele.
Řešitel
Hana Gachová - Gymnázium Brno, Křenová, příspěvková organizace
Instituce
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Další údaje o pracovišti
Biofyzika nukleových kyselin
Lektoři
Petra Školáková

DNA může vytvářet, kromě známé Watson-Crieckovy dvoušroubovice, také jiné typy sekundárních struktur. Mezi nejznámější a nejstudovanější patří čtyřřetězcové struktury. V oblastech DNA bohatých na cytozin se mohou vytvářet interkalované i-motivy. Tyto sekundární struktury jsou tvořeny hemiprotonizovanými C.C+ páry a stabilizovány kyselým pH. Bude nás zajímat výskyt těchto sekundárních struktur v buňce a tedy jejich možnost vzniku ve fyziologických podmínkách. Na syntetických oligonukleotidech budeme pomocí cirkulárně dichroické a UV absorpční spektroskopie studovat vliv sodných a draselných iontů na vznik a stabilitu cytozinového i-motivu.