Evoluce receptorů sloužících pro vstup virů do buněk netopýrů
K tématu se již není možné přihlásit. Školitel vybírá řešitele z přihlášených zájemců.- Instituce
- Ústav biologie obratlovců AV ČR, v. v. i.
- Další údaje o pracovišti
- Detašované pracoviště Studenec
- Lektoři
- Markéta Harazim
Netopýři slouží jako přirození hostitelé široké škály virů způsobujících onemocnění smrtelná pro většinu savců včetně člověka. Netopýři jsou přirozenými hostiteli nebo mezihostiteli například virů čeledi Filoviridae, způsobujících hemoragické horečky Marburg a Ebola, čeledi Coronaviridae, způsobující letální respirační syndromy nebo čeledi Rhabdoviridae, spojované s onemocněním vzteklinou. Schopnost virů infikovat buňky hostitele je závislá na koevolučním vývoji viru a jeho hostitele. Charakterizace koevolučních vztahů může přispět k identifikaci přirozeného hostitele konkrétních virů stejně jako k pochopení molekulárního mechanismu vstupu virů do buněk. Změny ve struktuře buněčných receptorů mohou ovlivňovat schopnost virů infikovat buňky hostitele, míru virové infekce i celkovou reakci hostitelů na virovou infekci. V rámci projektu bude student pracovat s DNA netopýrů, získá sekvence genů vybraných receptorů pro vstup virů do buněk a na základě sekvencí zhodnotí variabilitu a fylogenetické vztahy mezi sekvencemi jednotlivých receptorů. Laboratorní analýza bude probíhat na pracovišti Ústavu biologie obratlovců AV ČR ve Studenci. impact of bat genetic diversity on theirLaboratorníLaboratorní
analýza bude probíhat na pracovišti Ústavu biologie obratlovců AV ČR ve Studenci.
analýza bude probíhat na pracovišti Ústavu biologie obratlovců AV ČR ve Studenci.analýza bude probíhat na pracovišti Ústavu biologie obratlovců AV ČR ve Studenci.analýza bude probíhat na pracovišti Ústavu biologie obratlovců AV ČR ve Studenci.Laboratorní
analýza bude probíhat na pracovišti Ústavu biologie obratlovců AV ČR ve Studenci.
analýza bude probíhat na pracovišti Ústavu biologie obratlovců AV ČR ve Studenci.
pracoanalýza bude probíhat na pracovišti Ústavu biologie obratlovců AV ČR ve Studenci.potential to serve as
natural host
s of viruses
.
Although
bat
-
borne viruses include causative agents of diseases lethal
to humans, we lack information about the virus
-
bat interaction. The project will investigate the
genetic variability
of the viral cell entry receptors
using
next
-
generation sequencing methods
.
T
he
sequencing
results will be analyzed using bioinformatics methods including
protein
structure modelling
.
The viral cell entry receptors might influence the outcome of viral
infection in bats in comparison to other mammalian host species and the
molecular interactions
will be modelled
by protein docking. The differences in interaction and affinity of the viral
proteins and cellular receptors in bats and other mammal
s
may provide insight
s
into differences
in the disease outcome.
The
results
of the
project will
enhance
the current knowledge of
the
diversity of receptors used by
bat
-
borne viruses
and
virus
-
host
molecular interactions
.