Pro školitele

V rámci projektu bude studentka pracovat s nádorovými buněčnými liniemi po působení derivátu kyseliny retinové, které se využívá  například při léčbě akutní promyelocytická   leukémie (APL). Obecně, retinoidy, jako nukleární receptory ovlivňují významně buněčný růst, diferenciaci nebo apoptózu a v posledních letech jsou studovány pro jejich značný potenciál při léčbě rakoviny a chemoprevenci.

S využitím různých proteomických technik se budou sledovat změny na proteinovém profilu daných buněk a na jejich základě se pak bude vyhodnocovat míra efektivnosti all - trans retinové kyseliny. Cílem práce bude jednak studium vybraných typů proteinů - markerů a jejich změny v expresi, typu posttranslačních modifikací apod., ale i optimalizace jednotlivých analytických přístupů a jejich porovnání.

V experimentální části bude zahrnuta práce s buňkami, jejich kultivace, izolace proteinů, následná separace a purifikace pro další analytické zpracování pomocí gelové elektroforézy, různých specifických značení až po finální identifikaci proteinů pomocí MALDI hmotnostní spektrometrie. Součástí bude rovněž práce s databázemi, zpracování získaných analytických dat, stejně tak i studium příslušné literatury a vypracování přehledné aktuální rešerše k dané problematice.