Pro školitele

Jedním z nejdůležitějších aspektů pro udržení rovnováhy v přírodě je biodiverzita. Proto je potřeba ji chránit a snažit se o její zachování v nejvyšší možné míře. S největší biodiverzitou se můžeme setkat v tropech. Specifickým případem jsou ostrovy. Kvůli jejich izolovanosti od zbytku pevniny, docházelo ke kolonizaci ve vlnách. Tento způsob kolonizace měl za následek adaptivní radiaci, což je velmi rychlý vznik nových druhů díky množství volných nik. Následkem adaptivní radiace je vznik druhů, které nikde jinde nežijí, tzv endemické druhy. Nicméně právě endemické druhy patří k druhům nejohroženějším. Hrozbu pro ně představují druhy invazní, které jsou díky člověku rozšířeny po celém světě a s nimi i jejich patogeny.

Právě takovým ostrovem s velmi vysokým počtem endemitů je Nová Guinea. V její východní části, na území státu Papua Nová Guinea (PNG), je z cca 167 popsaných druhů hlodavců, vačnatců a ptakořitných, 147 druhů endemických (Vejmělka, 2020). Najdeme zde nejen vačnatce, kteří sem migrovali v několika vlnách z Austrálie, ale i hlodavce, kteří kolonizovali Novou Guineu z Indonésie přes ostrov Sulawesi. Jedná se o hlodavce kmene Rattini a Hydromyini. Dodnes zde dochází k objevování nových savčích druhů. Nicméně invazní druhy najdeme i zde. Jedná se především o hlodavce z kmene Rattini - Rattus rattus a Rattus exulans. Netopýři na PNG tvoří jednu z nejpočetnějších skupin obratlovců. Najdeme zde přes 90 endemických druhů. Nicméně o jejich krevních patogenech nevíme téměř nic.

Cílem stáže bude zjištění prevalence a charakterizace linií krevních parazitů (kam patří i prvok Trypanosoma, nebo malárie) u hlodavců, vačnatců a netopýrů z Papuy-Nové Guiney a u druhů invazních. Jelikož Papua-Nová Guinea byla kolonizována hlodavci a vačnatci v několika vlnách z různých oblastí, očekáváme, že zde bude unikátní výskyt a diverzita i jejich krevních parazitů. Zajímavé bude sledovat distribuci krevních parazitů, kteří byli na ostrov zavlečeni spolu s invazními druhy krys. Díky unikátní geografii ostrova budeme rovněž sledovat distribuci patogenů na výškovém gradientu, který sahá až do nadmořské výšky 3 700m n.m. Během stáže se student naučí základní molekulární metody, mezi které patří izolace DNA, analýza vzorků pomocí metody nested PCR, elektroforéza, sekvenování a vyhodnocení získaných dat.