Kultivace, transformace a sekvenace časně divergujících hub a basidiomycetních kvasinek
Téma již má řešitele.- Řešitel
- Tudor-Alexandru Stoican - Gymnázium Matyáše Lercha, Brno, Žižkova 55, příspěvková organizace
- Instituce
- Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
- Fakulta/ústav
- Radiobiologie a buněčná biologie
- Další údaje o pracovišti
- SYMBIT
- Lektoři
- Vratislav Peška
Basidiomycetní kvasinky a časně divergující houby patří k méně známým skupinám organizmů. Přesto jsou tyto houby evolučně i biotechnologicky významné. Obzvláště basidiomycetní kvasinky otevírají cestu k molekulárně biologickému studiu stopkovýtrusých hub, protože jejich kvasinkový charakter značně usnadňuje kultivaci a manipulaci v laboratorních podmínkách. V nedávných studiích se ukázalo, že transformace těchto organizmů lze dosáhnout, podobně jako u rostlin, pomocí půdní bakterie Agrobacterium tumefaciens nebo biolistickou metodou.
Cílem této práce bude zvládnout kultivaci vybraných druhů časně divergujících hub a basidiomycetních kvasinek v laboratorních podmínkách. Dále bude v rámci tohoto projektu optimalizována extrakce nukleových kyselin za účelem sekvenace genomu a transkriptomu. Při úspěšné kultivaci bude experimentálně navozována sporulace a z připravených haploidních kultur bude vytvářen mutantní kmen s deficiencí v syntéze uracilu. Takový kmen bude nakonec publikován a využíván jako akceptorový kmen genetických modifikací a bude odeslán do sbírky mikroorganismů, aby byl dostupný širší výzkumné komunitě.
Student se v průběhu projektu naučí laboratorní práci s buněčnými kulturami, základním metodám molekulární biologie i pokročilým analýzám typu zpracování dat ze sekvenace nové generace.