Metody analýzy metabolomických dat
Téma dosud nemá řešitele. Máš-li o něj zájem, zaregistruj se a přihlaš se k tématu.- Instituce
- Ústav výzkumu globální změny AV ČR, v. v. i.
- Další údaje o pracovišti
- Laboratoř ekologické fyziologie rostlin
- Lektoři
- Renata Divinová
Metabolomika je věda zabývající se studiem malých molekul v těle a souvisejících metabolických drah. Tyto informace nám pomáhají porozumět spojení mezi genotypem a fenotypem organismu. Stejně jako u jiných "omických" technik vytváří metabolomická analýza rozsáhlé a komplexní soubory dat. K tomu, abychom mohli získaná data interpretovat je zapotřebí různých statistických a grafických metod. Cílem práce bude tyto metody nastudovat z odborné literatury a následně je aplikovat v prostředí R (programovací jazyk a prostředí určené pro statistickou analýzu dat a jejich grafické zobrazení).
Data student obdrží již v upravené formě vhodné pro analýzu (samotné laboratorní práce se student neúčastní, nicméně v případě zájmu bude možné laboratoř navštívit a práci si vyzkoušet).
V rámci SOČ se student naučí pracovat s programovacím jazykem R a osvojí si principy vědecké práce od studia literatury až po interpretaci výsledků a diskuzi. Předpokladem je znalost anglického jazyka a vlastní počítač.