Metody analýzy metabolomických dat

Téma dosud nemá řešitele. Máš-li o něj zájem, zaregistruj se a přihlaš se k tématu.
Instituce
Ústav výzkumu globální změny AV ČR, v. v. i.
Další údaje o pracovišti
Laboratoř ekologické fyziologie rostlin
Lektoři
Renata Divinová

Metabolomika je věda zabývající se studiem malých molekul v těle a souvisejících metabolických drah. Tyto informace nám pomáhají porozumět spojení mezi genotypem a fenotypem organismu. Stejně jako u jiných "omických" technik vytváří metabolomická analýza rozsáhlé a komplexní soubory dat. K tomu, abychom mohli získaná data interpretovat je zapotřebí různých statistických a grafických metod. Cílem práce bude tyto metody nastudovat z odborné literatury a následně je aplikovat v prostředí R (programovací jazyk a prostředí určené pro statistickou analýzu dat a jejich grafické zobrazení). 

 

Data student obdrží již v upravené formě vhodné pro analýzu (samotné laboratorní práce se student neúčastní, nicméně v případě zájmu bude možné laboratoř navštívit a práci si vyzkoušet).

 

V rámci SOČ se student naučí pracovat s programovacím jazykem R a osvojí si principy vědecké práce od studia literatury až po interpretaci výsledků a diskuzi. Předpokladem je znalost anglického jazyka a vlastní počítač.