Automatizace stanovení směrovosti mikrokapilár ve tkáni pomocí magnetické rezonance
Téma dosud nemá řešitele. Máš-li o něj zájem, zaregistruj se a přihlaš se k tématu.- Instituce
- Ústav přístrojové techniky AV ČR, v. v. i.
- Další údaje o pracovišti
- Oddělení Magnetická rezonance a kryogenika
- Lektoři
- Jiří Kratochvíla
Magnetická rezonance (MR) je lékařská zobrazovací modalita, která využívá neionizující záření ve srovnání například s rentgenovou počítačovou tomografií. MR zobrazení je důležitým nástrojem pro diagnostiku a sledování účinků léčby v medicíně, jde totiž o unikátní modalitu neinvazivně poskytující anatomické, funkční a molekulární informace o tkáních.
MR perfuzní zobrazování se používá především pro diagnostiku a sledování účinků léčby v onkologii, neurologii a kardiologii. Perfuzní parametry poskytované perfuzním zobrazováním s kontrastní látkou popisují stav perfuze a kapilární permeability (propustnosti) ve tkáni. Poruchy perfuze nebo kapilární permeability jsou ukazateli různých patologií (tumory, edémy nebo ischemie). Při léčbě nádorů se parametry perfuze mění v řádu dnů ve srovnání s měsíci při běžně používaných kritériích měření velikosti léze (RECIST). Dříve pozorovaná změna vývoje nádoru poskytuje více času a možností změnit léčbu a zvýšit efektivitu nákladů na léčbu.
Dostupné metody perfuzního zobrazování poskytují popis perfuzních parametrů (průtok krve, objem krve, objem intersticiálního prostoru, propustnost cévní stěny, směrovost mikrokapilár a podobně). Právě parametry směrovosti mikrokapilár jsou předmětem této práce. Tyto parametry odlišují tkáně s chaotickou orientací mikrocév od uspořádané orientace. Nádory mají velmi heterogenní a variabilní vaskulární strukturu a v případě úspěšné léčby často dochází k vaskulární normalizaci mikrokapilár. Cílem této práce automatizovat proces perfuzní analýzy naměřených dat s kontrastní látkou pro odhad parametrů směrovosti mikrocév.
Náplň práce lze strukturovat následovně. Pochopení principů MR zobrazování se zaměřením na metody perfuze s kontrastní látkou. Měření na animálním systému NMR Bruker 9,4T na perfuzním fantomu aproximujícím reálnou tkáň. Dále student upraví program pro stanovení perfuzních parametrů tak, aby automatizoval výpočet odhadů směrovosti mikrokapilár. Naměřená data poté zpracuje upraveným programem a vyhodnotí výsledky.
Mezi důležité prekvizity uchazeče o tuto práci patří možnost fyzicky se účastnit řešení na pracovišti AVČR v Brně, schopnost číst anglický text a znalost programování.