Supervisors

Vstupním materiálem pro řadu vyšetření je tzv. nátěr, kdy se odebraný vzorek (např. aspirát z kostní dřeně, periferní krev) rozetře na sklíčko, nechá se usušit a poté se dále zpracovává a barví. Barvené nátěry se primárně připravují pro detailní mikroskopické vyšetření odebraných buněk, což napomáhá při stanovení diagnózy, monitorování průběhu onemocnění nebo reakce na léčbu. Sklíčka s nátěry se následně archivují měsíce až roky. Takto archivované vzorky později mohou posloužit jako cenný zdroj materiálu pro retrospektivní studie. Lze s nimi provést dodatečná vyšetření, která v době odběru nebyla indikována nebo pro ně nebyla dostupná potřebná technologie. Archivní materiál je obzvláště cenný v případech, kdy neexistuje jiný vhodný vzorek, např. pokud je osoba již zesnulá a analýza její DNA může být přínosná pro žijící příbuzné. K získání dostatečného množství DNA je však nutné použít speciální extrakční metody, jelikož se na sklíčku nachází pouze nízké množství buněk. Úkolem studenta/studentky bude zavést na našem pracovišti metodiku pro izolaci DNA z archivních nátěrů. Student(ka) bude metodu optimalizovat na vyřazených anonymizovaných vzorcích s cílem získat dostatek kvalitní DNA, která bude vhodná pro následné analýzy (tj. především sekvenování nové generace). Výsledkem práce bude protokol, který zaměstnanci budou moci rutinně využívat pro výzkum a indikovaná vyšetření konkrétních pacientů. Zavedení této metodiky rozšíří možnosti diagnostiky a výzkumu v oblasti genetických onemocnění na našem pracovišti.