Příprava biosenzoru na měření pH v buněčném prostředí pomocí i-motivu DNA
Téma dosud nemá řešitele. Máš-li o něj zájem, zaregistruj se a přihlaš se k tématu.- Instituce
- Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
- Další údaje o pracovišti
- Biofyzika nukleových kyselin
- Lektoři
- Petra Školáková
DNA může vytvářet, kromě známé Watson-Crieckovy dvoušroubovice, také jiné typy sekundárních struktur. Mezi nejznámější a nejstudovanější patří čtyřřetězcové sekundární struktury, což jsou guaninové kvadruplexy a cytosinové (interkalované) i-motivy. I-motivy jsou formovány prostřednictvím hemiprotonizovaných C.C+ párů a stabilizovány kyselým pH. Stabilita i-motivů úzce souvisí s délkou bloku po sobě jdoucích cytozinů. Srovnáváním stability a výběrem vhodné kombinace oligonukleotidů duálně značených fluorescenčními značkami, se budeme snažit vybrat vhodnou sestavu pro konstrukci biosenzoru. Pro tyto účely si zkusíme připravit vlastní duálně značené oligonukleotidy.